刘洋｜新疆大学｜学者主页

期刊论文

2026

CB-Dock3: an enhanced web server for protein–ligand blind docking

Yang Liu, Ji Ding, Jian-Hong Gan, Xiaoman Xiong, Fanjie Zong, Zhixiong Xiao, Yang Cao

Nucleic Acids Research

DOI

2025

参与天然态相互作用的关键残基总数决定蛋白质折叠速率

刘洋，王坤，张颖，吕军

《内蒙古大学学报(自然科学版)》

2025

秸秆焦掺氨燃烧过程中焦–氨相互作用及氮转化机理的分子动力学研究

王鑫雨，马滕，李卓玲，刘洋，余波，陈玉民，翟明，周怀春

《工程热物理学报》

2024

A structure-based virtual screening identifies a novel MDM2 antagonist in the activation of the p53 signaling and inhibition of tumor growth

Qing-yong Hu, Lei Li, Yu-huang Li, Hai-bo Zhang, Tao Deng, Yang Liu, Feng-Tian Li, Zhipeng Xiao, Yang Cao

Acta Pharmacologica Sinica

DOI

2023

基于LAMMPS的煤纳米孔隙中甲烷吸附和流动规律研究

刘洋

《西安科技大学》

2022

FitDock: protein-ligand docking by template fitting

Xiaocong Yang, Yang Liu, Jianhong Gan, Zhixiong Xiao, Yang Cao

Briefings Bioinform.

DOI

2022

DrugRep: an automatic virtual screening server for drug repurposing

Jian-hong Gan, Jixiang Liu, Yang Liu, Shu-wen Chen, Wen-tao Dai, Zhixiong Xiao, Yang Cao

Acta Pharmacologica Sinica

DOI

2022

CB-Dock2: improved protein–ligand blind docking by integrating cavity detection, docking and homologous template fitting

Yang Liu, Xiaocong Yang, Jianhong Gan, Shuang Chen, Zhixiong Xiao, Yang Cao

Nucleic Acids Res.

DOI

2022

基于分子动力学方法研究间规聚丙烯温度相关性的热输运性质

高建树，邵磊山，刘洋，李静静，蒋文军，何慧

《石油化工》

2022

γ-TiAl加工过程中粗糙表面对材料去除和亚表面缺陷影响的分子动力学模拟（英文）

杨晟泽，曹卉，刘洋，姚鹏，冯瑞成

《稀有金属材料与工程》

2021

DrugDevCovid19: An Atlas of Anti-COVID-19 Compounds Derived by Computer-Aided Drug Design

Yang Liu, Jianhong Gan, Rongqi Wang, Xiaocong Yang, Zhixiong Xiao, Yang Cao

Molecules

DOI

2019

CB-Dock: a web server for cavity detection-guided protein–ligand blind docking

Yang Liu, Maximilian Grimm, Wen-tao Dai, Mu-chun Hou, Zhixiong Xiao, Yang Cao

Acta Pharmacologica Sinica

DOI

2019

基于分子动力学的磨粒微切削单晶铁数值分析

李俊烨，刘洋，卢慧，孟文卿，杨兆军，张心明

《吉林大学学报(工学版)》

DOI

2007

纳米丝拉伸及纳米薄膜沉积过程的分子动力学模拟

刘洋

《兰州大学》

2004

简化线形大分子动力学模型

刘洋，付庄，赵言正，曹其新

《系统仿真学报》

Protein-Ligand Blind Docking Using CB-Dock2.

Yang Liu, Yang Cao

Methods in molecular biology

DOI

会议论文

2015

气体在煤中扩散行为的分子动力学模拟

刘洋，冯妍卉，张欣欣

《高等教育学会工程热物理专业委员会第二十一届全国学术会议论文集——传热传质学专辑》

2010

水合自由能计算及分子间相互作用

戴建兴，刘洋，孙淮

《中国化学会第27届学术年会第15分会场摘要集》

2010

第一原理分子动力学(CPMD)研究氨基硼烷分解放氢机理

王琳，刘洋，李丰，孙淮

《中国化学会第27届学术年会第08分会场摘要集》

2009

MOFs材料的Flexible力场开发与应用

孙迎新，付嘉，戴建兴，刘洋，孙淮

《第十届全国计算(机)化学学术会议》

2008

过渡金属配合物分子力场的开发

刘洋，熊振海，孙淮

《中国化学会第26届学术年会化学信息学与化学计量学分会场论文集》

2008

大规模分子力场数据库的建立

李丰，施玥，陈清，刘洋，孙淮

《中国化学会第26届学术年会化学信息学与化学计量学分会场论文集》

2004

超冗余线形大分子动力学建模与仿真

付庄，刘洋

《中国科协第五届青年学术年会》

刘洋

精选作品

期刊论文

CB-Dock3: an enhanced web server for protein–ligand blind docking

参与天然态相互作用的关键残基总数决定蛋白质折叠速率

秸秆焦掺氨燃烧过程中焦–氨相互作用及氮转化机理的分子动力学研究

A structure-based virtual screening identifies a novel MDM2 antagonist in the activation of the p53 signaling and inhibition of tumor growth

基于LAMMPS的煤纳米孔隙中甲烷吸附和流动规律研究

FitDock: protein-ligand docking by template fitting

DrugRep: an automatic virtual screening server for drug repurposing

CB-Dock2: improved protein–ligand blind docking by integrating cavity detection, docking and homologous template fitting

基于分子动力学方法研究间规聚丙烯温度相关性的热输运性质

γ-TiAl加工过程中粗糙表面对材料去除和亚表面缺陷影响的分子动力学模拟（英文）

DrugDevCovid19: An Atlas of Anti-COVID-19 Compounds Derived by Computer-Aided Drug Design

CB-Dock: a web server for cavity detection-guided protein–ligand blind docking

基于分子动力学的磨粒微切削单晶铁数值分析

纳米丝拉伸及纳米薄膜沉积过程的分子动力学模拟

简化线形大分子动力学模型

Protein-Ligand Blind Docking Using CB-Dock2.

会议论文

气体在煤中扩散行为的分子动力学模拟

水合自由能计算及分子间相互作用

第一原理分子动力学(CPMD)研究氨基硼烷分解放氢机理

MOFs材料的Flexible力场开发与应用

过渡金属配合物分子力场的开发

大规模分子力场数据库的建立

超冗余线形大分子动力学建模与仿真

研究方向